玫瑰十字会的教义与信条
关于玫瑰十字兄弟会的实际哲学信念、政治志向与人道活动，皆无可靠资料可考。其奥秘本质，至今仍旧不可侵犯；任何对玫瑰十字哲学的诠释，无论宣称为何，终究止于推测。
证据显示，两个不同的玫瑰十字体系很可能并存：一是内在组织，成员从不向世人揭示身分或教导；二是外在团体，受内在团体监督。金石骑士克里斯蒂安・罗森克罗伊茨的象征性坟墓，很可能便是此外在团体；其灵则存于更高境地。一六一四年之后百余年，外在团体或以自身名义，或以若干入门成员之名，流通各式小册与宣言。这些著作显然意在迷惑、误导调查者，从而有效隐藏兄弟会的真实意图。
当玫瑰十字传统在十七世纪成为哲学「风尚」，冒充者流通相关文献，企图趁势图利。兄弟会自身布下的巧妙机关，与江湖术士拙劣的文学伪作，交织成双重帷幕；内在组织便在帷幕之后，以全然不同于公开宣扬的原则与目的，默默推进其志业。玫瑰十字弟兄们为了隐藏自己，故意任由外界的误解流传，并称此乃掩护其活动与行踪的「云雾」。
玫瑰十字传统的实质与秘传教义，或许可经由分析如其影般的外传著作，略窥端倪。《玫瑰十字兄弟会告白》乃其最重要的「云雾」之一，R.C. 兄弟会试图为自身存在辩护，并阐明（或至少暗示）教团的目的与活动。此《玫瑰十字兄弟会告白》原分十四章，兹概述如下。
致欧洲学者的《玫瑰十字兄弟会告白》
第一章：勿因仓促判断或偏见，误解我们先前在《玫瑰十字兄弟会宣言》中有关本会的陈述。耶和华眼见文明衰败，遂欲拯救人类：祂将昔日只传予选民的秘密，揭示给愿意接受者，并强加于抗拒者。由此智慧，敬虔者将获拯救；不敬虔者的忧患则必加增。虽我教团真意已载于《玫瑰十字兄弟会宣言》，误解仍生，致我们被诬为异端与叛逆。此文但求阐明立场，使欧洲学者愿与我们同工，依尊贵创立者之意，传播神圣知识。
第二章：多人宣称今日哲学体系已然完备；我们则断言其虚假，且必因内在弱点而速朽。然则，正如自然为每一新疾预备疗方，我兄弟会亦已为世界哲学制度的沉疴，备下解药。玫瑰十字会的秘传哲学，奠基于统摄一切学术、科学与技艺的至高知识。藉这套神启体系来探究天地，多涉神学与医学，少及法学；然最主要者，在钻研人自身，因其本性中藏有至高奥秘。若当今学者接受邀请，加入兄弟会，我们将向他们揭示自然隐秘运作的秘密与奇迹，前所未闻。
第三章：莫以为我们轻视此文简述的秘密。我们不能尽述兄弟会的奇迹，以免无知者震骇，庸众又因不解而加以嘲弄。我们也担心，宣言如此慷慨地公开秘密，反会使许多人困惑；因为他们既不明白第六时代的奇迹，也未察觉即将来临的巨变。他们如同置身光明世界的盲人，只能凭触觉辨识事物。〔「视觉」象征灵性认知；「触觉」象征物质感官。〕
第四章：我们深信，借由深入思索人类心智的创造与生命的奥秘，藉天使与诸灵协助，并凭经验与长久观察，我们敬爱的基督徒父兄 C.R.C. 已蒙神智慧充分觉照：即便世上一切书籍文献尽毁，科学根基倾颓，玫瑰十字兄弟会仍能在神圣真理与正直基石上，重建世界思想的构架。因我等知识既深且全，凡欲理解玫瑰十字兄弟会奥秘者，无法立刻获此智慧，必须在理解与知识中逐步成长。故此，我兄弟会内分诸阶，人须逐级攀升，方抵大奥秘。既然神已为我们点亮第六灯台，与其徘徊于世俗无知的迷宫，何不循此道追寻真理？
况且，领受此知识者，将成一切艺术与工艺的大师；无有秘密能隐藏；过去、现在与未来的一切善工，皆向他们敞开。整个世界将如一本书卷，科学与神学的矛盾亦得调和。世人啊，欢欣吧！因时候已到，神命定增添兄弟会人数；此工我们欣然担当。智慧之门今向世界敞开，但弟兄们只向足够资格者显现；因为即使对自己子女，也不得泄露所知。领受灵性真理的资格不能承袭，人须在自身灵魂中演化。
第五章：纵然有人指摘我等过于轻率，竟向虔敬者、智者、王公与农人广散宝藏；我们仍未负所托。《玫瑰十字兄弟会宣言》虽以五种语言发表，唯具资格者能解其意。吾会社不为猎奇者窥见，只向严谨而诚笃的求道者敞开；然而，我等以五国母语流通此书，使列邦义人纵非学者，仍得闻我消息。不配者纵千次喧嚷、千次求见，然神已令我们充耳不闻，并以云环护我等仆人，免受任何暴力侵害。是故，人眼如今不得见我们，除非此人已藉得鹰之力。我等更宣告：必改革欧洲诸邦政制，依达姆卡尔哲人所立之典范塑形。凡渴求知识者，必各按其悟性领受。虚伪神学的统治终将倾覆，神将凭其所拣选的哲人，使祂的旨意彰显于人。
第六章：篇幅所限，仅需申明：我等父兄 C.R.C. 生于 1378 年，享寿百有六岁而逝，将向世界传扬哲思与宗教真谛之业遗予我等。兄弟会向一切真诚求道者敞开；然我等亦公言警示虚妄与不敬之徒：尔等既无法背叛，亦不能伤损我等，因神护佑此会；凡意图加害者，其奸谋必返诸自身，而兄弟会之宝藏毫发无伤，终将为雄狮所用，建立其国。
第七章：我等宣告：在世界终结以前，神将降下一场灵性光明的洪流，以缓解人世苦楚。那些早已渗入人类艺术、科学、宗教与政制中的虚妄与黑暗，令智者亦难觅实在之途；它们将被彻底扫除，并立下唯一准则，使众生皆得共享真理的果实。世人不会认明我等乃此变革之推手；他们将说，此乃时代自行演进之果。将至的革新极其宏大；然玫瑰十字兄弟会不将此神圣改革的荣耀据为己有，因许多非我会友的诚实、真知、睿智之士，亦将以其才智与著作，催其早临。我等作证：宁可磐石起身效力，也绝不缺少义人来执行神在地上的旨意。
第八章：为免世人疑窦，我等宣告神已在天界遣使显兆，即蛇夫座与天鹅座中新星，昭示选民大会即将召开。此足证明：神在可见的自然之中，早已为少数具慧眼者揭示一切将临之事的征兆与印记。神予人双目、两孔鼻、双耳，却仅赐一舌。眼、鼻、耳收纳自然智慧入心，惟舌能将之宣说。历代皆有蒙觉照者，得以看见、嗅到、尝知或听闻神旨意；然不久将有一日，凡曾见、曾嗅、曾尝、曾闻者，皆要开口宣说，真理必得揭示。然而在启示此正义之前，世人须先沉沉睡去，待那毒杯醉意散尽；杯中所盛，正是神学葡萄藤酿出的虚妄生命。而后世人向德性与悟性敞开胸怀，迎接真理的朝曦。
第九章：我等掌握一种魔法文字，摹自那神圣字母；神正是以这套字母，将其旨意写在天界与世间自然的面貌。借此新语言，我等解读神对一切受造物的旨意；正如天文学家预测日月之蚀，我等亦预知教会的晦暗及其历时之久暂。我等的语言，犹如亚当堕落前与以诺所用的语言；虽然我们能以此神圣语言领会并阐发自身奥秘，却无法以拉丁语为之，因拉丁语已遭巴别之乱玷污。
第十章：虽我等仍受若干权要反对阻挠，迫使必须隐迹潜形，但仍劝勉凡愿入我会者，当持续勤研《圣经》，因如此行者距我已不远。我意并非教人将《圣经》终日挂在口边，乃教人追寻其真实永恒之含义；此义极少为神学家、科学家或数学家所发现，因其眼界常为本宗派之成见所蔽。我等作证：自太初以来，所赐予世人之书无一部比《圣经》更卓越。拥有它者有福，阅读它者更有福，理解它者最有福，而遵行它者最似神。
第十一章：我们期望读者审慎看待《玫瑰十字兄弟会宣言》中，关于金属嬗变与万灵药的论述。这两项事业固然皆可由人达成；但我们也担心，许多真正伟大的心智，若将研究限于金属嬗变，便会偏离追求真知与理解的正道。当一人手握疗病、解贫、获世间尊荣的力量，便身陷重重诱惑；除非兼具真知与彻悟，否则将成人类的大患。炼金术士纵然掌握卑金属嬗变之术，若其觉悟程度不及所造财富，便足以作尽恶事。因此我们断言，人必先得知识、德性与彻悟；尔后，万物方能加诸其身。我们控诉基督教会犯下重罪：手握权柄却不善用；故在此预言，它将因罪孽深重而倾覆，其冠冕终归虚无。
第十二章：在《玫瑰十字兄弟会告白》终章，我们诚挚劝诫诸君，抛弃伪炼金术士与哲学家的无益之作，此类书籍充斥当世。他们轻慢神圣三位一体，以虚妄谜语欺惑盲信之徒。其中最甚者乃戏台伶人，机巧过人，足以欺世。此乃人类福祉之敌，混入求善者中，令真理愈发难寻。请信我们：真理简明，无需遮掩；虚假则繁复、深藏、傲慢，其编造的俗世知识闪耀著如神般的光泽，常被误作神圣智慧。诸位智者当远离这些虚妄教导，来到我们这里；我们不求金钱，只愿慷慨献上更丰盛的宝藏。我们不取你们财物，而邀你们共享我们所有。我们不嘲讽譬喻，而请你们通透一切譬喻与秘密。我们不要求你们接收我们，而是邀你们踏入我们的王屋与宫殿；这非为我们自身，只因神之灵如此命令，因我们最卓越的父兄 C.R.C. 的心愿，也因当下时势所需甚巨。
第十三章：既已清楚表明我们的立场：我们真诚信奉基督，否弃教宗制度，将生命献予真正的哲学与高尚的生活。我们每日邀请并接纳各国贤者加入兄弟会，使其共享神之光；你们何不加入我们，以完善自身、发展诸艺，并服务世界？若踏出此步，世间宝藏将同时交付于你们；笼罩人类知识、使世俗学术流于虚妄的黑暗，也将永远消散。
第十四章：我们再次警告那些为黄金所惑，或可能因巨富而沉溺安逸奢华的人：切勿以喧嚷扰乱我们神圣的寂静；虽有灵药能治百病、启迪众人，但神不容人舍弃德行、勤勉与正直，却欲得真知。若非神允许，我们绝不向人显现。凡妄想能未经神允许，就分享我等灵性财富者，只会在寻找我们的途中丧命，无缘我们所获的幸福。
玫瑰十字兄弟会
约翰・瓦伦丁・安德烈亚常被视为《玫瑰十字兄弟会告白》的作者。然而，安德烈埃是否允许培根爵士以其名为笔名，仍是争议所在。此事在《忧郁的解剖》导言中，有两处关键线索。该书一六二一年初版，署名小德谟克利特，后世认定是罗伯特・伯顿；而伯顿又被疑与培根爵士关系匪浅。其中一处资料意味深长地暗示，一六二一年《忧郁的解剖》出版时，玫瑰十字兄弟会的创始者尚在人世。这段话因文意隐晦，未受注意，多数玫瑰十字研究者也因此忽略了它。同书另有一简短重要注释：「约翰・瓦伦特・安德烈亚斯，维鲁兰勋爵。」这一行直接将约翰・瓦伦丁・安德烈亚与维鲁兰勋爵培根相关联；文中的标点也暗示，两者其实是同一人。
在玫瑰十字的辩护者中，约翰・海登尤为突出；他自署「神的仆人，自然的秘书」。在奇书《揭开玫瑰十字》里，他对玫瑰十字兄弟会作出如下隐晦却珍贵的描述：
「如今有一群自称玫瑰十字会员的人，是居于天界边陲的神圣兄弟会。他们奉世界大元帅之命行事，如同大君的耳目，洞悉一切。他们说这些玫瑰十字会员，如摩西般受炽天使之光启迪，依元素次第修行：土炼为水，水为气，气为火。」他又宣称这些神秘弟兄具备多形变化之能，可随意显现任何形态。同书序言中，他列举玫瑰十字开悟者的奇异能力：
「我将告诉你们玫瑰十字会员是何等人，且摩西是他们之父；他是神之子；有人说他们属以利亚教团，有人说是以西结的门徒；看来玫瑰十字会员不仅深谙摩西之学，亦已获行奇迹之力，如同摩西、以利亚、以西结及众先知；能随意转移至他处，例如哈巴谷自犹太地前往巴比伦，或腓利为太监施洗后，前往亚锁都；其中一人曾替我前往德文郡拜访友人，并于当日将信携回至伦敦；而此行通常需四天。他们教我卓越的占星与地震预言之术；止息城邑瘟疫；平息狂风暴雨；镇住海浪河涛；行走于空中；破却女巫邪相；治愈百病。」
约翰・海登的著作，被视为玫瑰十字重要文献。他很可能与克里斯多福・海登爵士有亲缘关系；后者是「受炽天使之光启迪的玫瑰十字会员」。已故的 F. 利・加德纳，乃英格兰玫瑰十字会名誉秘书，认为他将玫瑰十字知识传给约翰・海登。在《玫瑰十字书目》中，加德纳论及约翰・海登道：「整体而言，从其著作的内在证据观之，他似乎仅经历玫瑰十字教团较低阶次，却将其中许多奥秘公诸于世。」约翰・海登游历甚广，足迹遍及阿拉伯、埃及、波斯与欧洲各地；其《智者之冠：镶以天使、行星、金属等》，或称《玫瑰十字的荣光》的传记导言有所记述。此书自称是克里斯蒂安・罗森克罗伊茨自阿拉伯带回的神秘 M 书英译。
托马斯・沃恩（笔名尤金尼乌斯・菲拉勒忒斯）是另一位教团的拥护者，印证了约翰・海登所言：玫瑰十字启悟者可随意隐身。「玫瑰十字兄弟会能在这白雾中移动。『凡欲与我们交通者，必得在此光中得见；否则，除非出于我们意志，他永不能见我们。』」
玫瑰十字兄弟会是一个庄严而自主的团体，随心运用炼金术、卡巴拉学、占星术与魔法象征以达致其特殊目的，却完全独立于其所借用的各崇拜体系。兄弟会怀抱三大目标：
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废除一切君主政体，代之以哲学菁英的治理。玫瑰十字会员致力将群众从专制中解放，产生了现代民主制度。十八世纪初，玫瑰十字会员将目光转向新兴的美洲殖民地；彼时该地正逐渐凝聚为新世界伟大民族的核心。美国独立战争代表其首个重大政治实验，最后建立了一个基于神圣与自然法原则的国家政府。玫瑰十字会员留下了美国国玺的设计，作为其秘密活动的永恒印证。玫瑰十字会员亦推动了法国大革命，然此次尝试未竟全功，因革命者的狂热终究失控，酿成了恐怖统治。
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改革科学、哲学与伦理。玫瑰十字会宣称，物质的艺术与科学，乃神圣智慧投下的影子；人唯有深入自然最幽微的内里，方能触及实在，获得真知。他们虽自称基督徒，骨子里却是柏拉图的信徒，并深谙早期希伯来与印度教神学的玄奥。有证据显示，玫瑰十字会意在复兴上古秘仪，视其为传授永恒奥义的首要法门。他们很可能就是这些秘仪的延续者，正因保持绝对隐秘与重重掩护，才得以抵御教条化基督教的抹杀。他们严守至高奥秘，即「三重自我」的本质及其相互关系。因此，除非他们主动现身，否则无人能确知该会是否存在，又有何宗旨。玫瑰十字兄弟会正借由其外在组织，悄然构筑一种环境或载体，以待尊贵的 C.R.C. 弟兄最终降临其中，为人类完成那宏大事业，兼具灵性与物质。
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发现能治百病的万灵药。玫瑰十字会寻得生命灵药，似非虚言。伊莱亚斯・阿什莫尔在《不列颠化学剧场》中写道，此会虽在英格兰未获赏识，在欧陆却备受推崇。伊丽莎白女王两度罹患天花，皆由玫瑰十字弟兄治愈；诺福克伯爵的痲疯病，亦得会中医者妙手回春。约翰・海登的文字更暗示，兄弟会握有延续人类生命的秘密，唯其限度不越神所定之时：
「最终，他们能依同一法门，令每位逝去的弟兄复生，并存续多代；其法则见第四卷。玫瑰十字兄弟会由此创立，最初仅有四人；他们历经死而复生，直至基督降生，遂循星辰指引前往犹太的伯利恒，朝拜躺在母亲怀中的救主。他们开启宝藏，献上黄金、乳香与没药，旋即依神命归返居所。此四人历数百年相继返老还童，创制了一种魔法的语言与文字，并编成巨帙辞典；我们至今仍日日以此赞美荣耀神，并从中窥见大智慧。待 C.R. 弟兄在合宜的『子宫』中苏醒，他们决意再纳新人入会。」
此处所称「子宫」，明指玻璃匣或容器，弟兄们葬于其中。它亦名「哲人之卵」。经一定时日，哲人破壳而出，活动一段时间后，再退回玻璃壳内。所谓玫瑰十字疗愈万病之药，既可指具有实际疗效的物质，亦可象征灵性觉悟。此乃真正的疗愈，人一旦获得，便能洞见真理。无知是最重的病；疗愈无知者，乃万药之王。完美的玫瑰十字之药，意在治愈国家、种族与个人。
在一份早期未刊手稿中，某无名哲人称，炼金术、卡巴拉学、占星术与魔法本属神圣之学；然经扭曲，已成虚妄教条，反令求道者愈行愈远。作者将灵性成就之路分为三步，或称三座「山」，此乃理解玫瑰十字秘传的重要钥匙。最低者为哲学山，其次为卡巴拉山，最高者为魔法山。三山代表灵性成长的连续阶段。无名作者继而说道：
「『哲学』是理解自然运作的知识；人凭这知识攀登，超越感官的局限。『卡巴拉学』则是天使与天界众生的语言；通晓此语者，能与神的使者对话。而山巅之上，是『神圣魔法』之学——亦即神自身的语言，神亲自于此揭示万物的本质。」
愈来愈多人相信，若玫瑰十字主义的真相公诸于世，势必引起极大震撼。玫瑰十字符号蕴含多层意义，而其核心的秘密，至今仍未显露。玫瑰十字会所立足的高山，依然笼罩于云雾之中；弟兄们便将自身与奥秘，隐藏在这片云里。迈可・梅尔曾写：「《玫瑰十字兄弟会宣言》与《玫瑰十字兄弟会告白》所述俱为真实。若指责兄弟会许诺得多而实践少，实属幼稚。此处一如他处，蒙召者众，蒙选者寡。会中大师以玫瑰为最终奖赏，却要入门者先背负十字架。」（参见迈尔《喧嚣后的沉默》，及德・昆西《玫瑰十字会与共济会》）
玫瑰与十字的形影，出现在利奇菲尔德教堂章厅的彩绘玻璃上；沃尔特・康拉德・阿伦斯伯格相信，培根勋爵与其母安葬于此。罗伯特・伯顿 1628 年版《忧郁的解剖》献辞页上，有一枚浮水印，图案是心形中的十字架玫瑰。
玫瑰与十字，是玫瑰十字会员的根本象征。玫瑰属阴，十字属阳，两者皆是普遍的生殖象征。如汤玛斯・英曼、哈格雷夫・詹宁斯与理查・佩恩・奈特等博学之士所观察，玫瑰与十字确实象征生殖的过程；然而这些学者似未能穿透象征的帷幕，未能明了：物质界的创造奥秘，只是灵性界神圣创造奥秘的投影。正因这些象征带有生殖意涵，便有人诬指玫瑰十字会员与圣殿骑士团曾在秘密仪式中举行淫亵祭典。炼金蒸馏器固然象征子宫，但在「第二次诞生」的寓言之下，隐藏著远为深邃的意义。既然「生成」是物质存在的关键，玫瑰十字兄弟会自然选择表现此一过程的符号作为标记。再生既是通往灵性生命的关键，他们便以玫瑰与十字架为象征，代表人的低等世俗本性与高等永恒本性结合，从而获得救赎。玫瑰十字也是象征「万灵药」配方的秘符。
